MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Borrelia burgdorferi ZS7 plasmid ZS7_lp17

Total Repeats: 216

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011782	AAC	2	6	303	308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875588
2	NC_011782	CATG	2	8	326	333	25 %	25 %	25 %	25 %	218875588
3	NC_011782	AAAT	2	8	366	373	75 %	25 %	0 %	0 %	218875588
4	NC_011782	ATT	2	6	387	392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
5	NC_011782	A	6	6	396	401	100 %	0 %	0 %	0 %	218875588
6	NC_011782	CAAAAA	2	12	430	441	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	218875588
7	NC_011782	CCT	2	6	446	451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	218875588
8	NC_011782	AT	3	6	456	461	50 %	50 %	0 %	0 %	218875588
9	NC_011782	CAA	2	6	462	467	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875588
10	NC_011782	A	6	6	470	475	100 %	0 %	0 %	0 %	218875588
11	NC_011782	TAT	2	6	548	553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
12	NC_011782	A	6	6	573	578	100 %	0 %	0 %	0 %	218875588
13	NC_011782	ATT	2	6	598	603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875588
14	NC_011782	ACT	3	9	638	646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875588
15	NC_011782	ATGG	2	8	777	784	25 %	25 %	50 %	0 %	218875594
16	NC_011782	AAATT	2	10	823	832	60 %	40 %	0 %	0 %	218875594
17	NC_011782	TAA	2	6	833	838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875594
18	NC_011782	A	7	7	1015	1021	100 %	0 %	0 %	0 %	218875594
19	NC_011782	TTG	2	6	1106	1111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875594
20	NC_011782	GAT	2	6	1455	1460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875592
21	NC_011782	TAA	2	6	2087	2092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875584
22	NC_011782	AC	3	6	2102	2107	50 %	0 %	0 %	50 %	218875584
23	NC_011782	ACA	2	6	2111	2116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875584
24	NC_011782	A	6	6	2130	2135	100 %	0 %	0 %	0 %	218875584
25	NC_011782	TAG	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875584
26	NC_011782	ATAG	2	8	2185	2192	50 %	25 %	25 %	0 %	218875584
27	NC_011782	ATAGAC	2	12	2221	2232	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	218875584
28	NC_011782	TTA	2	6	2233	2238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875584
29	NC_011782	T	6	6	2253	2258	0 %	100 %	0 %	0 %	218875584
30	NC_011782	AAC	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875584
31	NC_011782	TAA	2	6	2283	2288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875584
32	NC_011782	A	7	7	2300	2306	100 %	0 %	0 %	0 %	218875584
33	NC_011782	TAC	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875584
34	NC_011782	ACT	2	6	2369	2374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875584
35	NC_011782	ATG	2	6	4272	4277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875582
36	NC_011782	TTA	2	6	4287	4292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875582
37	NC_011782	ATA	2	6	4303	4308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875582
38	NC_011782	AGA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875582
39	NC_011782	A	6	6	4378	4383	100 %	0 %	0 %	0 %	218875582
40	NC_011782	AAG	2	6	4387	4392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875582
41	NC_011782	A	6	6	4403	4408	100 %	0 %	0 %	0 %	218875582
42	NC_011782	AT	3	6	4413	4418	50 %	50 %	0 %	0 %	218875582
43	NC_011782	AT	3	6	4422	4427	50 %	50 %	0 %	0 %	218875582
44	NC_011782	AT	3	6	5727	5732	50 %	50 %	0 %	0 %	218875587
45	NC_011782	ATTA	2	8	5793	5800	50 %	50 %	0 %	0 %	218875587
46	NC_011782	TCTA	2	8	5806	5813	25 %	50 %	0 %	25 %	218875587
47	NC_011782	AATC	2	8	5870	5877	50 %	25 %	0 %	25 %	218875587
48	NC_011782	A	7	7	5889	5895	100 %	0 %	0 %	0 %	218875587
49	NC_011782	AATG	2	8	5940	5947	50 %	25 %	25 %	0 %	218875587
50	NC_011782	TCA	2	6	6000	6005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875587
51	NC_011782	AT	3	6	6011	6016	50 %	50 %	0 %	0 %	218875587
52	NC_011782	CAAT	2	8	6055	6062	50 %	25 %	0 %	25 %	218875587
53	NC_011782	T	7	7	6097	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	218875587
54	NC_011782	ATA	2	6	6184	6189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875587
55	NC_011782	TTA	2	6	6212	6217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875587
56	NC_011782	ATA	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875587
57	NC_011782	GAA	2	6	6270	6275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875587
58	NC_011782	TTA	2	6	6337	6342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875587
59	NC_011782	A	6	6	6350	6355	100 %	0 %	0 %	0 %	218875587
60	NC_011782	CCA	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	218875591
61	NC_011782	TTA	2	6	6569	6574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
62	NC_011782	CAT	2	6	6588	6593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875591
63	NC_011782	TGC	2	6	6616	6621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	218875591
64	NC_011782	TAT	2	6	6624	6629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
65	NC_011782	CAA	2	6	6642	6647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875591
66	NC_011782	ATA	2	6	6671	6676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
67	NC_011782	T	7	7	6701	6707	0 %	100 %	0 %	0 %	218875591
68	NC_011782	TGT	2	6	6718	6723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	218875591
69	NC_011782	TAA	2	6	6761	6766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
70	NC_011782	ACA	2	6	6767	6772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875591
71	NC_011782	TTA	2	6	6825	6830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875591
72	NC_011782	AAAAT	2	10	6878	6887	80 %	20 %	0 %	0 %	218875591
73	NC_011782	AAT	2	6	6954	6959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875591
74	NC_011782	A	8	8	7037	7044	100 %	0 %	0 %	0 %	218875591
75	NC_011782	AAATA	2	10	7050	7059	80 %	20 %	0 %	0 %	218875591
76	NC_011782	AAAT	2	8	7065	7072	75 %	25 %	0 %	0 %	218875591
77	NC_011782	ATT	2	6	7331	7336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
78	NC_011782	TACT	2	8	7339	7346	25 %	50 %	0 %	25 %	218875585
79	NC_011782	A	6	6	7351	7356	100 %	0 %	0 %	0 %	218875585
80	NC_011782	A	7	7	7358	7364	100 %	0 %	0 %	0 %	218875585
81	NC_011782	A	6	6	7410	7415	100 %	0 %	0 %	0 %	218875585
82	NC_011782	CAAA	2	8	7421	7428	75 %	0 %	0 %	25 %	218875585
83	NC_011782	TAT	2	6	7468	7473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
84	NC_011782	GAA	2	6	7562	7567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875585
85	NC_011782	ATG	2	6	7589	7594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	218875585
86	NC_011782	AGAAA	2	10	7682	7691	80 %	0 %	20 %	0 %	218875585
87	NC_011782	TAT	2	6	7714	7719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
88	NC_011782	A	6	6	7720	7725	100 %	0 %	0 %	0 %	218875585
89	NC_011782	AAC	2	6	7757	7762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
90	NC_011782	TAC	2	6	7852	7857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	218875585
91	NC_011782	AAC	2	6	7900	7905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
92	NC_011782	GAA	2	6	7943	7948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875585
93	NC_011782	TCAAA	2	10	7964	7973	60 %	20 %	0 %	20 %	218875585
94	NC_011782	CAA	2	6	7984	7989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875585
95	NC_011782	A	6	6	7995	8000	100 %	0 %	0 %	0 %	218875585
96	NC_011782	G	6	6	8044	8049	0 %	0 %	100 %	0 %	218875585
97	NC_011782	TCT	2	6	8064	8069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	218875585
98	NC_011782	T	6	6	8083	8088	0 %	100 %	0 %	0 %	218875585
99	NC_011782	AAT	2	6	8108	8113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875585
100	NC_011782	TTA	2	6	8180	8185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
101	NC_011782	A	8	8	8199	8206	100 %	0 %	0 %	0 %	218875585
102	NC_011782	ATT	2	6	8254	8259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875585
103	NC_011782	AT	3	6	8462	8467	50 %	50 %	0 %	0 %	218875595
104	NC_011782	AGA	2	6	8469	8474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
105	NC_011782	A	6	6	8512	8517	100 %	0 %	0 %	0 %	218875595
106	NC_011782	AGA	2	6	8568	8573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
107	NC_011782	AGA	2	6	8602	8607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875595
108	NC_011782	GAAA	2	8	8631	8638	75 %	0 %	25 %	0 %	218875595
109	NC_011782	CAATT	2	10	8639	8648	40 %	40 %	0 %	20 %	218875595
110	NC_011782	AGCA	2	8	8657	8664	50 %	0 %	25 %	25 %	218875595
111	NC_011782	A	8	8	8664	8671	100 %	0 %	0 %	0 %	218875595
112	NC_011782	A	6	6	8715	8720	100 %	0 %	0 %	0 %	218875595
113	NC_011782	GATAA	2	10	8886	8895	60 %	20 %	20 %	0 %	218875589
114	NC_011782	ATA	2	6	8898	8903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
115	NC_011782	A	6	6	8909	8914	100 %	0 %	0 %	0 %	218875589
116	NC_011782	TAA	2	6	8933	8938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
117	NC_011782	AGA	2	6	8951	8956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	218875589
118	NC_011782	A	7	7	8974	8980	100 %	0 %	0 %	0 %	218875589
119	NC_011782	A	7	7	9036	9042	100 %	0 %	0 %	0 %	218875589
120	NC_011782	ACAA	2	8	9094	9101	75 %	0 %	0 %	25 %	218875589
121	NC_011782	ATA	2	6	9148	9153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
122	NC_011782	TAA	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
123	NC_011782	ATA	2	6	9178	9183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
124	NC_011782	A	7	7	9183	9189	100 %	0 %	0 %	0 %	218875589
125	NC_011782	ATCA	2	8	9191	9198	50 %	25 %	0 %	25 %	218875589
126	NC_011782	AT	3	6	9214	9219	50 %	50 %	0 %	0 %	218875589
127	NC_011782	TAA	2	6	9241	9246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
128	NC_011782	TA	3	6	9294	9299	50 %	50 %	0 %	0 %	218875589
129	NC_011782	CAAAA	2	10	9300	9309	80 %	0 %	0 %	20 %	218875589
130	NC_011782	ATT	2	6	9333	9338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	218875589
131	NC_011782	TAA	2	6	9350	9355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
132	NC_011782	A	7	7	9381	9387	100 %	0 %	0 %	0 %	218875589
133	NC_011782	CAA	2	6	9413	9418	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	218875589
134	NC_011782	AAT	2	6	9432	9437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	218875589
135	NC_011782	A	6	6	9440	9445	100 %	0 %	0 %	0 %	218875589
136	NC_011782	A	7	7	9538	9544	100 %	0 %	0 %	0 %	218875589
137	NC_011782	ATAA	2	8	9555	9562	75 %	25 %	0 %	0 %	218875589
138	NC_011782	AT	3	6	9578	9583	50 %	50 %	0 %	0 %	218875589
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.